NLS har verksamhet i fem sektorer för sina medlemsorganisationer: 
- Sektorn för förskola
- Sektorn för grundskola
- Sektorn för gymnasie- och yrkesutbildning
- Sektorn för ledare
- Sektorn för studerande
Sektorernas huvuduppgift är att agera som rådgivande organ till NLS styrelse samt främja informations- och erfarenhetsutbytet mellan medlemsorganisationerna. Samtliga sektorer utgår i sitt arbete dels från de frågeställningar som berör det egna verksamhetsområdet, dels från det som finns inskrivet i verksamhetsplanens tyngdpunktsområden.
Till sektorernas uppgift hör sektorspecifika frågor som tas upp efter behov.